2013年12月20日，上海交通大学深圳研究院在上海召开第一届理事会第三次会议。理事会由校领导、发展联络处、财务处、产研院、深圳校友会和深圳研究院组成。上海交通大学吴旦副校长兼理事长出席会议，会议由上海交通大学产研院常务副院长刘燕刚主持。本次会议特邀各深圳研发中心负责人参加。
    深圳研究院副院长王新德作理事会工作报告。回顾和总结深圳研究院2013年来的工作情况，研究院充分依托学校的科研优势和师资力量以及发挥深圳校友会的作用，以研究院为平台，加强产学研合作，开展高层次人才培养工作；进一步加强学校与深圳市政府战略合作关系，拓展合作领域，加快深圳研究院的建设和发展。
    为了加强研究院规范管理，更有效地为研发中心服务，与会代表就深圳研究院科研项目审批及经费管理办法进行讨论，探讨中心人事、经费、项目承接等事宜，为中心稳步发展出谋划策。
    理事会对研究院的工作给予了肯定，希望研究院要在转型时期，抓住机遇，确定工作重心、内容和目标，加快研究院产学研大楼建设和人才培养工作，进一步将深圳研究院做大、做实。