2007年2月16日，大连海事大学入驻深圳虚拟大学园暨大连海事大学深圳研究院仪式在深圳虚拟大学园隆重举行，深圳市委常委、常务副市长刘应力和大连海事大学校长王祖温参加了仪式，深圳市相关部门领导和大连海事大学校友共同见证了这个历史性时刻，。

大连海事大学入驻深圳虚拟大学园并成立深圳研究院主要是针对地处中国南海之滨的特区--深圳及珠江三角洲地区而设立的研究型、开放式、国际化的创新航运、物流人才培养和前沿应用科学的重要基地。作为港口城市，“以港强市”是深圳市的重点发展战略之一，以港航物流业为主要依托带动深圳市，乃至珠江三角洲经济的全面发展是深圳重要的发展目标。目前深圳港已步入世界大港行列，航运、物流企业蓬勃发展。针对港口发展和人才需求，大连海事大学将以培养航运、物流专业性人才和科技服务来支持深圳港口向强港转变。

大连海事大学是交通部所属的全国重点大学，拥有素质良好的教师队伍，具有承担国家、交通部等部门和相关企事业委托的科研课题，解决行业中的重大科技问题的能力。

   入驻深圳虚拟大学园及成立大连海事大学深圳研究院，大连海事大学将在泛珠江三角地区的战略窗口，将全面实施人才培养和科技合作，一方面开设高级航运管理硕士班（EMMA）、工商管理硕士班（MBA）、法律硕士(J.M)、公共管理硕士班（MPA）、工程硕士班、研究生进修班等，另一方面根据交通运输领域的长远发展及企业相关业务发展需求，积极为航运企业发展战略决策研究与咨询等重大决策做技术支持，以及航运企业发展中科技进步与科学研究等方面的科技服务，努力建设成为泛珠江三角地区乃至全国有影响力的具有航运行业特色的高级人才培养与科研基地。