17日的会议主要在香港城市大学和香港浸会大学举行，由实验室副主任陈荔博士主持。上午的会议主要讨论了藻毒素的研究进展与计划，下午与会嘉宾则围绕藻类自动在线观测系统和水产养殖环境监测与风险管理进行了讨论。18日上午会议分为两个平行部分，香港部分主要是由陈荔博士主持的写作研究基金申请报告，深圳部分则是由清华大学深圳研究生院蔡中华教授主持的海湾生态过程与生态系统再平衡分组专题讨论，与会嘉宾从深圳海湾生态状况、生态系统发生与演替规律、生态压力与系统演化等多个主题进行了热烈讨论与分享。18日下午全体与会嘉宾前往深圳大学城清华校区开会，与会的各位学术界领导和政府领导对于海湾生态修复和生物多样性可持续利用依次阐述了自身所在领域的观点。19日全天的会议在深圳举行，主要由两个分组专题讨论组成，上午是由毛献忠教授主持的污染物在海湾迁移转化与海湾生态修复策略研讨，讨论内容包括营养盐在海湾的分布；海湾水动力与水质交换；营养盐的沉积；食物链对营养盐的转换；生态位变化对营养盐移除效率的影响等。下午则是由毕洪生教授主持的海湾生态系统生物修复研讨，从围填海与富营养化海湾的生物修复和过度捕捞海湾生物修复效率两个方面对该主题进行阐述。

为期三天的海湾生态修复与生物多样性可持续利用研讨会在深圳西丽大学城落下帷幕，与会嘉宾纷纷表示会加强政府、科研院所与企业之间的联系与合作，以期共同推进海洋科学研究和海洋环境保护的发展。